Danh sách các đội bóng có sự thay đổi so với năm 2012

^[a] Vicem Hải Phòng xuống hạng nhưng tiếp tục chơi vì mua lại suất của Khatoco Khánh Hòa.^[b] Bà Rịa Vũng Tàu, Trẻ Khatoco Khánh Hoà thăng hạng nhưng thiếu kinh phí nên bỏ giải.[2][3][4]^[c] CLB Hà Nội (á quân) không tham dự vì cùng một ông bầu với Hà Nội T&T, vì vậy suất đá chính thức V.League 1 2013 thuộc về Đồng Nai (hạng ba).